biosemiotics

Instrucciones para Codex — biosemiotics

Este atlas educativo de POCUS se escribe en español para el médico de primer contacto. Alcy conserva la responsabilidad clínica y editorial.

Antes de trabajar

• Lee completo CLAUDE.md: es el manual compartido, también para Codex.
• Lee mapa-maestro-biosemiotics.md para el orden y la taxonomía del contenido.
• Comprueba git status y git worktree list; conserva el trabajo ajeno.
• En PowerShell, ejecuta . ./activar-entorno.ps1 para activar Python y UTF-8.
• Ejecuta python scripts/preflight.py y comunica fallos previos al cambio.
• Para configurar Astra, validar la migración o revertirla, lee CODEX.md.

Contrato que debe conservarse

• Los .qmd son la fuente de verdad. Corrige la fuente y regenera los derivados; no edites build/ a mano. Solo se versionan build/index.json y build/atlas-inject.html.
• No inventes cifras, PMID, DOI, URLs, fechas de revisión ni identificadores de Ghost. Verifica las referencias con PubMed y Crossref según el manual.
• Conserva significante → significado → decisión, los encabezados obligatorios, abstract de 40–80 palabras y límites/falsos positivos. Escribe en español claro.
• Conserva borrador, revisado y publicado con sus requisitos. La validación estructural no demuestra revisión clínica ni consentimiento para publicar.
• Las imágenes requieren archivo local, fuente, crédito y licencia verificables, y vienen SOLO de Wikimedia Commons: nunca generadas con IA.
• Para publicar en Ghost usa la skill .agents/skills/ghost/: publicación nueva en web y por email a los suscriptores, y pie canónico pegado una sola vez.
• Mantén Python 3.9+, Quarto y LuaLaTeX, y las verificaciones existentes.
• Usa el worktree principal y una rama por unidad de trabajo. Para publicación, respeta los roles secuenciales y PR apilados del manual: el publicador no regenera el índice; el proveedor lo hace tras congelar el PR padre.

Alcance, permisos y verificación

Completa el trabajo autorizado y reversible sin repetir preguntas ya resueltas. Prepara un resultado revisable antes de solicitar una decisión que realmente falte. Una solicitud de plan no autoriza editar, publicar ni fusionar. La publicación requiere la autorización aplicable del usuario; preparar un borrador no equivale a aprobarlo. No amplíes permisos ni copies las reglas de .claude/settings.local.json a Codex.

Prueba lo que corresponda al cambio. Para Python usa python -m unittest discover -s tests; para contenido sigue las comprobaciones del manual. No repitas pruebas correctas sin cambios o evidencia nueva. Distingue pruebas ejecutadas, fallos previos y verificaciones pendientes por herramientas.

La guía de biosemiotics-atlas está incorporada en docs/atlas/README.md y sus referencias locales. Consúltalas al crear o revisar entidades. No depende de una skill instalada ni de archivos en Descargas. Usa las plantillas actuales de assets/ y scripts/validacion.py para comprobar el contrato; la guía documenta las diferencias del paquete antiguo y los límites del XML.

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